Pour l'accomplissement des missions définies à l'article 2, le STEMO Aquitaine Sud est composé des 3 unités éducatives suivantes :
- une unité éducative de milieu ouvert de Pau, sise 3, rue René-Dorme, 64000 Pau ;
- une unité éducative de milieu ouvert de Bayonne, sise 13, allées Marines, 64100 Bayonne ;
- une unité éducative de milieu ouvert de Mont-de-Marsan, sise 36, place Pancaut, 40000 Mont-de-Marsan.