Pour l'accomplissement de ses missions, l'EPEI de Strasbourg est constitué de deux unités se répartissant comme suit :
-une unité éducative d'hébergement collectif, dénommée “ UEHC Strasbourg ”, sise 10, rue de l'Auberge-de-Jeunesse, 67000 Strasbourg, d'une capacité de 12 places, pour des garçons et filles âgés de 13 ans révolus jusqu'à 21 ans, complétée d'une mission d'hébergement diversifié, sise 7B, rue de Rosheim, 67200 Strasbourg, d'une capacité de 18 places, pour des garçons et filles âgés de 13 ans révolus jusqu'à 21 ans ;
-une unité éducative d'activités de jour, dénommée “ UEAJ Strasbourg ”, sise 7, rue Livio, 67000 Strasbourg, d'une capacité de 24 places pour des garçons et filles âgés de 13 ans révolus jusqu'à 21 ans.