Le service comprend :
-le secrétariat général, chargé d'assurer la gestion des ressources humaines de proximité, la gestion budgétaire, de gérer le parc informatique et d'apporter un soutien utilisateur aux agents du SNEAS ;
-le pôle opérationnel.
Le pôle opérationnel comprend :
-le bureau du recueil et de l'analyse de l'information, chargé de recueillir, exploiter et analyser les informations afin de proposer un avis ;
-le bureau de la supervision et de la coordination, chargé d'assurer l'interface du service avec les demandeurs à l'origine des enquêtes et de coordonner et contrôler les enquêtes réalisées par le bureau de recueil et d'analyse de l'information ;
-le bureau des affaires juridiques.