L'enseignement de première année de deuxième cycle s'étend sur deux semestres. Il est composé d'unités d'enseignement consacrées :
1° Aux matières fondamentales de la muséologie ;
2° A l'histoire de l'art ;
3° A l'historiographie ;
4° Aux sources de la recherche ;
5° Aux langues étrangères.
En outre, chaque élève doit choisir au second semestre des séminaires de spécialisation en conservation-restauration, en médiation et dans d'autres domaines connexes de la muséologie.
Enfin, chaque élève doit rédiger un mémoire d'étude dont l'encadrement est assuré par un responsable de mémoire au sein d'un groupe de recherche.