Le comité consultatif est présidé par le préfet de la Charente-Maritime ou par son représentant.
Le préfet nomme par arrêté les membres du comité. Celui-ci comprend notamment des représentants des propriétaires, du conseil municipal de la commune d'Yves, du conseil général de la Charente-Maritime, des services départementaux intéressés, des associations de protection de la nature ainsi que le délégué régional à l'architecture et à l'environnement de la région Poitou-Charentes et des personnalités scientifiques.
Le comité consultatif peut créer en son sein des commissions spécialisées.
Il se réunit au moins deux fois par an à l'initiative de son président.