La direction de la modernisation et de l'administration territoriale comprend :
― le service de la modernisation de l'action publique ;
― la sous-direction du corps préfectoral et des hauts fonctionnaires ;
― la sous-direction de l'administration territoriale ;
― le bureau des élections et des études politiques.
Le directeur est assisté d'un adjoint, chef de service.
Le bureau des élections et des études politiques est placé auprès du directeur.