La sous-direction antiterroriste comprend :
- la division de la stratégie et de l'appui opérationnel, à laquelle est rattaché l'état-major ;
- la division nationale pour la répression du terrorisme international et séparatiste ;
- la division nationale de recherche et de surveillance ;
- la division administrative.
Elle est chargée de la prévention et de la répression du terrorisme national et international.