La sous-direction de la planification et de la gestion des crises comprend :
― le bureau de la planification, des exercices et des retours d'expérience ;
― le bureau des opérations et de la gestion de crise ;
― le bureau d'analyse et de gestion des risques ;
― le bureau de l'alerte, de la sensibilisation et de l'éducation des publics ;
― le pôle transverse d'information géographique et de géomatique.
Le Centre national civil et militaire de formation et d'entraînement aux événements de nature nucléaire, radiologique, biologique, chimique et explosive est rattaché fonctionnellement à cette sous-direction.