La gestion administrative de l'école est confiée, sous l'autorité du directeur général de l'institut français du pétrole, à un directeur assisté d'un conseil de perfectionnement.
Ce directeur est nommé, par arrêté du ministre de l'industrie, pour une durée de trois ans, sur proposition du directeur général de l'institut français du pétrole, après consultation du conseil de perfectionnement.
Le conseil de perfectionnement comprend, sous la présidence du directeur des carburants, outre le directeur général de l'institut français du pétrole :
Les quinze membres suivants, nommés pour quatre ans par arrêté du ministre de l'industrie :
Six personnalités choisies parmi les dirigeants de l'industrie pétrolière ;
Trois personnalités dispensant des enseignements supérieurs ;
Trois représentants élus du personnel enseignant de l'école ;
Trois anciens élèves de l'école.
Trois représentants élus par les élèves puis nommés pour un an par le directeur des carburants.
Le conseil nomme en son sein un vice-président. Pour celles de ses délibérations qui portent sur l'examen de cas individuels intéressant les personnels de l'école, le conseil délibère hors la présence de ses membres élus.
Le conseil de perfectionnement émet sur toutes les questions concernant l'organisation générale et le perfectionnement des programmes d'enseignement et des méthodes pédagogiques de l'école des avis qui sont exprimés au directeur général de l'institut français du pétrole.