Le secrétariat général (SNIA/SG) est chargé des ressources humaines, des moyens généraux et des domaines administratif, juridique, financier et comptable du service.
Il a également en charge :
― le pilotage de la performance ;
― la politique informatique du service et sa mise en œuvre ;
― la politique d'archivage et de documentation du service ;
― la politique de formation et de développement des compétences.