Le major général de la marine est assisté de quatre sous-chefs d'état-major et de trois autorités de coordination.
Les sous-chefs d'état-major sont :
- le sous-chef d'état-major " opérations aéronavales " ;
- le sous-chef d'état-major " plans et programmes " ;
- le sous-chef d'état-major " ressources humaines " ;
- le sous-chef d'état-major " soutiens et finances ".
Les autorités de coordination sont :
- l'autorité de coordination pour les affaires nucléaires, la prévention et la protection de l'environnement ;
- l'autorité de coordination pour les questions internationales ;
- l'autorité de coordination de la fonction garde-côtes, fonction assurée par le sous-chef d'état-major " opérations aéronavales ".
En cas d'absence ou d'empêchement, le major général de la marine est remplacé par l'un des sous-chefs d'état-major.
Le major général de la marine dispose en outre :
- du délégué aux réserves de la marine, dont les attributions sont fixées par arrêté ;
- d'un médecin des armées, conseiller pour les affaires de santé, placé auprès de lui par la direction centrale du service de santé des armées ;
- du centre d'expertise des programmes navals et du centre de pilotage des systèmes d'information de la marine, organismes extérieurs de la marine dont les attributions sont fixées par instruction.