Pour l'accomplissement de ses missions, ce service est constitué de trois unités se répartissant comme suit :
― une unité éducative de milieu ouvert, dénommée "Montbéliard", sise 15, rue de la Petite-Hollande, 25200 Montbéliard ;
― une unité éducative d'activités de jour, dénommée "Aire urbaine", sise 10, rue des Nos, 90400 Danjoutin, d'une capacité théorique d'accueil de 24 places ;
― une unité éducative de milieu ouvert, dénommée "Belfort", sise 5, rue de la République, 90000 Belfort.