Le contrôleur budgétaire et comptable ministériel du ministère chargé de l'écologie, du développement durable, des transports et du logement est désigné pour exercer le contrôle financier des établissements publics administratifs suivants :
Agence de financement des infrastructures de transport de France (AFITF) ;
Agence nationale pour la garantie des droits des mineurs (ANGDM) ;
Agence nationale de l'habitat (ANAH) ;
Etablissement public Météo-France ;
Institut français des sciences et technologies des transports, de l'aménagement et des réseaux (IFSTTAR) ;
Office national de la chasse et de la faune sauvage (ONCFS).