La direction générale de l'alimentation comprend :
1. Le service de l'alimentation.
2. Le service de la prévention des risques sanitaires de la production primaire.
3. Le service de la coordination des actions sanitaires.
4. La mission des urgences sanitaires.
5. La mission d'appui au pilotage de la performance.
6. La brigade d'enquêtes vétérinaires et phytosanitaires.
7. La mission des affaires générales.
8. La mission de valorisation des orientations stratégiques.
9. Le secrétariat interministériel du Conseil national de l'alimentation (CNA).