L'établissement est administré par un conseil de dix-huit membres composé de :
1° Douze représentants des collectivités territoriales ou de leurs groupements :
― un représentant du conseil régional des Pays de la Loire désigné par son organe délibérant parmi ses membres ;
― sept représentants du conseil général de la Vendée désignés par son organe délibérant parmi ses membres ;
― quatre représentants des établissements publics de coopération intercommunale à fiscalité propre désignés dans les conditions fixées à l'article 5.
2° Trois représentants des chambres consulaires désignés par leur organe délibérant :
― un représentant pour la chambre de commerce et d'industrie du département de la Vendée ;
― un représentant pour la chambre d'agriculture du département de la Vendée ;
― un représentant pour la chambre de métiers et de l'artisanat du département de la Vendée.
3° Trois représentants de l'Etat :
― le préfet de la Vendée, ou son représentant ;
― le directeur départemental des finances publiques du département de la Vendée ou son représentant ;
― le directeur départemental des territoires et de la mer du département de la Vendée ou son représentant.
Les représentants de l'Etat ne prennent pas part au vote lors de l'examen de la délibération fixant le montant de la ressource fiscale prévue à l'article 1607 ter du code général des impôts.
Le préfet de la Vendée publie par arrêté la liste nominative des membres du conseil d'administration.