Le secrétariat général est organisé comme suit :
Est directement rattachée au secrétaire général l'unité de gestion des carrières.
Le département de la programmation et de la gestion comprend :
- la division de la programmation des travaux ;
- la division du budget et du contrôle de gestion ;
- la division des prestations financières, constitutive du centre de prestations financières.
Le département des ressources humaines comprend :
- la division du développement et de la valorisation des ressources humaines ;
- la division des parcours professionnels et du dialogue social ;
- la division de la gestion statutaire ;
- la division de l'administration et de la rémunération centrales ;
- la division du système de gestion et d'information du personnel.
Le département des services généraux comprend :
- la division des marchés et de l'immobilier ;
- la division logistique de la direction générale.
Le département de l'informatique comprend :
-la division des logiciels ;
-la division des ordinateurs et systèmes ;
-la division de coordination des moyens informatiques ;
-la division de l'information et de la formation informatiques ;
-la division de la bureautique et de la micro-informatique.
Le département de l'organisation et des méthodes de la production comprend :
-la division des études et des méthodes de la production ;
-la division d'organisation de la production ;
-la division de la collecte.
La sous-direction " centre d'enquêtes statistiques " comprend le bureau des méthodes et de la coordination de la production, la division des moyens d'enquêtes et de diffusion, la division informatique et quatre divisions sectorielles. La sous-direction de l'ingénierie et de la coordination statistiques comprend le bureau de la méthodologie statistique et le bureau des nomenclatures. La sous-direction de l'informatique et de la bureautique comprend le bureau de la production et des infrastructures informatiques et le bureau de la politique et du développement des applications informatiques. Ces trois sous-directions sont coordonnées par un responsable de pôle auquel est rattachée la mission des affaires générales.