La direction des opérations a autorité sur les organismes extérieurs suivants dont les missions et l'organisation sont fixées par instruction :
1. Le service centralisé des achats ;
2. Le service du maintien en condition opérationnelle ;
3. L'unité de management Rafale (UM RAF) ;
4. L'unité de management Cœlacanthe (UM COE) ;
5. L'unité de management Horus (UM HOR) ;
6. L'unité de management Nucléaire, biologique et chimique (UM NBC) ;
7. L'unité de management Missiles et drones (UM MID) ;
8. L'unité de management Opérations d'armement terrestres (UM TER) ;
9. L'unité de management Opérations d'armement navales (UM NAV) ;
10. L'unité de management Opérations d'armement aéronautiques (UM AERO) ;
11. L'unité de management Opérations d'armement hélicoptères (UM HELI) ;
12. L'unité de management Espace et systèmes d'information opérationnels (UM ESIO) ;
13. L'établissement de contrôle de Cherbourg.