Le second concours, rattaché à la section des sciences, donne accès à une formation mixte médecine/sciences.
Les candidats au second concours, issus d'une scolarité effectuée exclusivement en université, doivent être susceptibles d'obtenir à la session de juin de l'année du concours une attestation de succès ou les crédits sanctionnant les deux premières années des études médicales ou des études pharmaceutiques.
Les épreuves d'admissibilité se déroulent à Paris et à Lyon.
Un candidat ne peut subir plus d'une fois les épreuves du second concours.