Le directeur général est nommé par décret en conseil des ministres sur proposition conjointe du ministre chargé de la recherche et du ministre chargé de la santé.
Le directeur général assure la direction de l'institut.
Il gère le personnel.
Il représente l'institut en justice et dans tous les actes de la vie civile.
Il assure l'exécution des délibérations du conseil d'administration.
Il est ordonnateur principal du budget de l'institut.
Il peut déléguer sa signature.
Il peut nommer des directeurs ou des conseillers scientifiques qui procèdent à toutes études et assurent toutes missions qu'il leur confie. Lorsque ces fonctions sont exercées à titre permanent, elles ne sont pas compatibles avec celles de membre du conseil d'administration ou des instances scientifiques mentionnées aux articles 5, 11, 13, 15 et 16 du présent décret.