Le conseil d'administration comprend, outre le haut-commissaire, président :
1° Trois représentants de l'Etat désignés par le haut-commissaire ;
2° Trois représentants de la Nouvelle-Calédonie élus par le congrès sur des listes comportant le même nombre de candidats que de sièges à pourvoir, sans suppression ni adjonction de noms, à la représentation proportionnelle à la plus forte moyenne ;
3° Un représentant de chacune des provinces choisi en son sein par chaque assemblée de province ;
4° Trois représentants du sénat coutumier désignés en son sein.
5° Trois représentants des organisations professionnelles agricoles désignés par le haut-commissaire sur proposition de celles-ci.
Les fonctions de membre du conseil d'administration sont incompatibles avec tout emploi rémunéré par l'agence.