La formation dispensée pendant l'année de stage se structure en trois périodes :
1° Une première période de formation constituée d'enseignements fondamentaux portant sur l'intégration au sein de l'environnement professionnel et la transition écologique, d'une durée d'environ trois semaines ;
2° Une deuxième période de formation comprenant des enseignements permettant de développer les connaissances spécifiquement maritimes des fonctionnaires stagiaires ;
3° Une troisième période de formation comprenant des enseignements de spécialisation en fonction de la nature des emplois offerts aux fonctionnaires stagiaires.
Seuls les agents détenant une attestation de suivi à l'issue de la première période peuvent suivre les deuxième et troisième périodes de formation.
Les deuxième et troisième périodes de formation se déroulent au cours de la première année suivant la prise de poste. Les enseignements sont assurés par l'Ecole du service public de la mer.
Le programme général de ces trois périodes est fixé en annexe II.