Les élèves de la spécialité génie maritime du cursus de formation initiale ingénieurs sont recrutés en licence 3 spécifique par la voie d'une sélection sur titre dont les critères sont fixés par l'ENSM ou par la voie du concours pour les étudiants issus des classes préparatoires aux grandes écoles, en spécialité physique-technologie.
Les élèves de la spécialité génie maritime du cursus de formation initiale ingénieurs sont recrutés en master 1 par la voie d'une sélection sur titre dont les critères sont fixés par l'ENSM. L'accès au master 1 est également proposé aux élèves ayant validé le cycle L du cursus de formation des officiers de 1re classe de la marine marchande/ingénieur.