Le directeur de la médecine des forces organise et gère les secteurs de médecine de prévention placés sous son autorité.
A ce titre :
1° Il établit et actualise un plan d'organisation des secteurs de médecine de prévention, après consultation éventuelle des autorités dont relèvent les organismes bénéficiaires ;
2° Il assure le fonctionnement et l'administration des secteurs de médecine de prévention en lien avec le coordonnateur national ;
3° Il propose à la direction centrale du service de santé des armées les moyens en personnel et en matériel qu'il estime nécessaires.
Pour assurer ces missions, il dispose pour chacun des secteurs de médecine de prévention d'un praticien qualifié en médecine du travail, désigné par le directeur central du service de santé des armées. Ce médecin dénommé conseiller expert en médecine de prévention assure un rôle d'expert, de conseil et de coordination dans son domaine de compétence, au profit du directeur de la médecine des forces pour le secteur dont il relève, ainsi que des médecins du travail et des autorités d'emploi au niveau local.
Chaque conseiller expert en médecine de prévention établit un rapport annuel d'activité pour son secteur. Ce rapport est transmis au coordonnateur national de la médecine de prévention du ministère de la défense et à l'inspecteur de la médecine de prévention dans les armées.