Il est créé, auprès du directeur de l'Ecole supérieure de l'éducation nationale, de l'enseignement supérieur et de la recherche, un conseil scientifique.
Ce conseil est un lieu de réflexion, d'échanges et de propositions d'évolutions de l'offre de formation. Il contribue également à la formation de stratégies d'amélioration de la qualité et de l'efficience du système de formation des personnels d'encadrement supérieur et des personnels d'encadrement formés par l'école.
Il contribue au développement des relations de l'école avec la communauté scientifique européenne et internationale dans les domaines de la formation d'adultes, de l'ingénierie pédagogique et du développement numérique.
Il peut également être consulté sur les projets de conventions avec les organismes de recherche ou toute autre institution avec lesquels l'ESENESR est en partenariat. Les résultats des activités de recherche et des actions de valorisation et de diffusion du modèle de formation dans lesquelles l'ESENESR est associée lui sont présentés.
Il émet des avis et des recommandations destinés à éclairer les choix de politique de formation et instruit les sujets qui lui sont indiqués par le directeur de l'école. Ses avis et recommandations sont remis par l'Ecole supérieure de l'éducation nationale, de l'enseignement supérieur et de la recherche au secrétaire général et à la directrice générale des ressources humaines du ministère de l'éducation nationale, de l'enseignement supérieur et de la recherche.