Dans leur champ respectif de compétences, les commissions scientifiques spécialisées donnent leur avis sur l'ensemble des activités de recherche menées par l'institut dans ses divers domaines d'intervention, y compris celles qui sont développées contractuellement avec des organismes publics ou privés.
Elles procèdent à l'évaluation :
― du contenu des recherches envisagées par l'institut ;
― des résultats des recherches en cours ou achevées ;
― et, à la demande du directeur général, des chercheurs ou des équipes de l'institut ayant une activité de recherche.
Les commissions transmettent leurs avis à la direction scientifique et aux directions opérationnelles de l'institut. Leurs présidents en font rapport annuellement devant le conseil scientifique.