Le CCRP est présidé par le directeur chargé des affaires stratégiques ou son représentant. Il comprend :
1° Un comité directeur ;
2° Un secrétariat permanent ;
3° Un sous-comité « prospective de défense » ;
4° Un sous-comité « coordination des études prospectives » ;
5° Un sous-comité « IRSEM ».
Ces trois sous-comités rendent compte annuellement au comité directeur de la mise en œuvre de la politique générale en matière de prospective de défense et de réflexion stratégique.