L'échelon de direction est implanté sur deux sites :
― le site de Muret ;
― le site de Castelnaudary spécialisé dans la maintenance.
Il comprend :
I. ― Le département opération (OP), dirigé par un chef de département auquel sont rattachés un responsable pédagogique, chef des instructeurs pour la formation avancée (OP/HT-CFI[FA]), et un chef des instructeurs en vol pour la formation initiale (OP/CFI[FI]), constitué par :
― la division études et méthodes et instruction sol (OP/Doc-CGI) ;
― la division activités hors centres (OP/AHC) ;
― la division gestion de production (OP/GP).
II. ― Le département technique (T), dirigé par un chef de département, constitué par :
― la division exploitation technique (T/ET) ;
― la division maintenance et production (T/MP) à laquelle est rattachée directement l'unité de maintenance du site de Castelnaudary ;
― la division informatique et simulation (T/IS).
III. ― Le secrétariat général (SG), dirigé par un secrétaire général assisté d'un adjoint, constitué par :
― la division ressources humaines (SG/RH) ;
― la division finances (SG/F) ;
― la division contrats et contrôle de gestion (SG/CCG) ;
― la division infrastructures et logistique (SG/IL) ;
― la division administration et moyens généraux du site spécialisé dans la maintenance de Castelnaudary (SG/AMG).