| DÉNOMINATION FRANÇAISE | AGENT | ESPÈCES | 
|---|---|---|
| Anémie infectieuse des équidés. | Virus de l'anémie infectieuse des équidés (Retroviridae, Lentivirus). | Equidés. | 
| Anémie infectieuse du saumon. | Virus de l'anémie infectieuse du saumon (Orthomyxoviridae, Isavirus). | Saumon atlantique (Salmo salar), truite arc-en-ciel (O. mykiss), truite fario (S. trutta). | 
| Botulisme. | Clostridium botulinum. | Volailles. | 
| Brucellose. | Toute Brucella autre que Brucella ovis. | Toutes espèces de mammifères. | 
| Clavelée. | Virus de la Clavelée (Poxviridae, Capripoxvirus). | Ovins. | 
| Cowdriose. | Ehrlichia (Cowdria) ruminantium. | Bovins, ovins et caprins. | 
| Dermatose nodulaire contagieuse. | Virus de la dermatose nodulaire contagieuse (Poxviridae, Capripoxvirus). | Bovins. | 
| Dourine. | Trypanosoma equiperdum. | Equidés. | 
| Encéphalite japonaise. | Virus de l'encéphalite japonaise (Flaviviridae, Flavivirus). | Equidés. | 
| Encéphalite West-Nile. | Virus West-Nile (Flaviviridae, Flavivirus). | Equidés. | 
| Encéphalite virale de type Venezuela. | Virus de l'encéphalomyélite virale du Venezuela (Togaviridae, Alphavirus). | Equidés. | 
| Encéphalites virales de type Est et Ouest. | Virus de l'encéphalomyélite virale de l'Est et de l'Ouest (Togaviridae, Alphavirus). | Equidés. | 
| Encéphalopathie spongiforme bovine (ESB). | Prion ou agent de l'encéphalopathie spongiforme bovine. | Bovins. | 
| Encéphalopathies spongiformes subaiguës transmissibles. | Prions ou agents des encéphalopathies spongiformes subaiguës transmissibles. | Ovins, caprins. | 
| Fièvre aphteuse. | Virus de la fièvre aphteuse (Picornaviridae, Aphtovirus). | Toutes espèces animales sensibles. | 
| Fièvre catarrhale du mouton. | Virus de la fièvre catarrhale du mouton (Reoviridae, Orbivirus). | Ruminants et camélidés. | 
| Fièvre charbonneuse. | Bacillus anthracis. | Toutes espèces de mammifères. | 
| Fièvre de la vallée du Rift. | Virus de la fièvre de la vallée du Rift (Bunyaviridae, Phlebovirus). | Bovins, ovins, caprins. | 
| Fièvres hémorragiques à filovirus. | Virus de Marburg et virus d'Ebola (Filoviridae, Marburgvirus et Ebolavirus). | Primates non humains. | 
| Herpèsvirose de la carpe. | Virus de l'herpèsvirose de la carpe (Herpesviridae, Herpesvirus). | Carpes (Cyprinus carpio). | 
| Herpèsvirose simiène de type B. | Herpès virus B (Herpesviridae, Simplexvirus). | Primates non humains. | 
| Hypodermose clinique. | Hypoderma bovis ou Hypoderma lineatum. | Bovins. | 
| Infection à Bonamia exitiosa. | Bonamia exitiosa. | Huîtres plates (australienne et du Chili). | 
| Infection à Bonamia ostreae. | Bonamia ostreae. | Huîtres plates (européenne, australienne, du Chili, du Pacifique, asiatique et d'Argentine). | 
| Infection à Marteilia refringens. | Marteilia refringens. | Huîtres plates (australienne, du Chili, européenne, d'Argentine) et moule (commune et méditerranéenne). | 
| Infection à Perkinsus marinus. | Perkinsus marinus. | Huîtres japonaises et de l'Atlantique. | 
| Infection à Microcytos mackini. | Microcytos mackini. | Huîtres plates (européenne et du Pacifique), huîtres japonaises et de l'Atlantique. | 
| Infestation due à Aethina tumida. | Aethina tumida. | Abeilles. | 
| Infestation due à Tropilaelaps. | Tropilaelaps clareae. | Abeilles. | 
| Influenza aviaire. | Virus de l'influenza aviaire (Orthomyxoviridae, Influenza A.). | Toutes espèces d'oiseaux. | 
| Leucose bovine enzootique. | Virus de la leucose bovine enzootique (Retroviridae, Deltaretrovirus). | Bovins. | 
| Loque américaine. | Paenibacillus larvae. | Abeilles. | 
| Maladie d'Aujeszky. | Herpèsvirus du porc (Herpesviridae, Varicellovirus). | Toutes espèces de mammifères. | 
| Maladie de la tête jaune. | Virus de la maladie de la tête jaune (Roniviridae, Okavirus). | Crevettes : brune, rose, Kuruma, tigrée brune, ligubam du Nord, bleue, à pattes blanches du Pacifique. | 
| Maladie de Nairobi. | Virus de la maladie de Nairobi (Bunyaviridae, Nairovirus). | Ovins, caprins. | 
| Maladie de Newcastle. | Virus de la maladie de Newcastle (Paramyxoviridae, Avulavirus). | Toutes espèces d'oiseaux. | 
| Maladie de Teschen. | Virus de la maladie de Teschen (Picornaviridae, Teschovirus). | Suidés. | 
| Maladie des points blancs. | Virus de la maladie des points blancs (Nimaviridae, Whispovirus). | Crustacés décapodes. | 
| Maladie hémorragique épizootique des cervidés. | Virus de la maladie épizootique des cervidés (Reoviridae, Orbivirus). | Cervidés. | 
| Maladie vésiculeuse du porc. | Virus de la maladie vésiculeuse du porc (Picornaviridae, Enterovirus). | Suidés. | 
| Morve. | Burkholderia mallei. | Equidés. | 
| Nécrose hématopoïétique infectieuse. | Virus de la nécrose hématopoïétique infectieuse (Rhabdoviridae, Novirhabdovirus). | Saumons : atlantique (S. salar), keta (O. keta), argenté (O. kisutch), japonais (O. masou), sockeye (O. nerka), chinook (O. tshawytscha), truite biwamasou (O. rhodurus) et truite arc-en-ciel (O. mykiss). | 
| Nécrose hématopoïétique épizootique. | Virus de la nécrose hématopoïétique épizootique (Iridoviridae, Ranavirus). | Truites arc-en-ciel et perche commune. | 
| Nosémose des abeilles. | Nosema spp. | Abeilles. | 
| Péripneumonie contagieuse bovine. | Mycoplasma mycoides sp. mycoides. | Bovinés. | 
| Peste bovine. | Virus de la peste bovine (Paramyxoviridae, Morbillivirus). | Ruminants et suidés. | 
| Peste des petits ruminants. | Virus de la peste des petits ruminants (Paramyxoviridae, Morbillivirus). | Ovins et caprins. | 
| Peste équine. | Virus de la peste équine (Reoviridae, Orbivirus). | Equidés. | 
| Peste porcine africaine. | Virus de la peste porcine africaine (Asfarviridae, Asfivirus). | Suidés. | 
| Peste porcine classique. | Virus de la peste porcine classique (Flaviviridae, Pestivirus). | Suidés. | 
| Pleuropneumonie contagieuse des petits ruminants. | Mycoplasma capricolum sp. capripneumoniae. | Ovins et caprins. | 
| Pullorose-typhose. | Salmonella Gallinarum Pullorum. | Toutes espèces d'oiseaux sauvages. | 
| Rage. | Virus de la rage (Rhabdoviridae, Lyssavirus). | Toutes espèces de mammifères. | 
| Salmonellose aviaire. | Salmonella Enteritidis, Salmonella Typhimurium, Salmonella Hadar, Salmonella Virchow et Salmonella Infantis. | Troupeaux de futurs reproducteurs et reproducteurs des espèces Gallus gallus. | 
| Salmonellose aviaire. | Salmonella Enteritidis, Salmonella Typhimurium. | Troupeaux de futurs reproducteurs et reproducteurs des espèces Meleagris gallopavo. | 
| Salmonellose aviaire. | Salmonella Enteritidis et Salmonella Typhimurium. | Troupeaux de poulettes futures pondeuses et de pondeuses d'œufs de consommation de l'espèce Gallus gallus. | 
| Salmonellose aviaire. | Salmonella identifiées dans les muscles. | Troupeaux de poulets de chair de l'espèce Gallus gallus. | 
| Septicémie hémorragique. | Pasteurella multocida B et E. | Bovins. | 
| Septicémie hémorragique virale. | Virus de la septicémie hémorragique virale (Rhabdoviridae, Novirhabdovirus). | Saumons du Pacifique, truites arc-en-ciel et fario, brochets, corrégones, ombres communs, turbots, morues de l'Atlantique et du Pacifique, harengs, aiglefins et sprats. | 
| Stomatite vésiculeuse. | Virus de la stomatite vésiculeuse (Rhabdoviridae, Vesiculovirus). | Bovins, équidés et suidés. | 
| Surra. | Trypanosoma evansi. | Equidés, camélidés. | 
| Syndrome de Taura. | Virus du syndrome de Taura (Dicistroviridae). | Crevettes ligubam du Nord, crevettes bleues et crevettes à pattes blanches du Pacifique. | 
| Syndrome ulcéreux épizootique. | Aphanomyces invadans. | Poissons exotiques des genres : Catla, Channa, Labeo, Mastacembelus, Mugil, Puntius et Trichogaster. | 
| Théilériose. | Theileria annulata. | Bovins. | 
| Trypanosome. | Trypanosoma vivax. | Bovins. | 
| Tuberculose. | Mycobacterium bovis et Mycobacterium tuberculosis. | Toutes espèces de mammifères. | 
| Variole caprine. | Virus de la variole caprine (Poxviridae, Capripoxvirus). | Caprins. |