Le secrétariat général comprend :
- le bureau du budget et de la comptabilité, chargé, pour l'ensemble de la direction, de la préparation et de l'exécution des lois de finances, de la comptabilité et de la coordination des réponses aux questions bugétaires ;
- le bureau de la gestion des personnels et de la logistique, chargé de la gestion prévisionnelle des emplois et des compétences de la direction, de la gestion administrative des personnels, des délégations de signature, de l'organisation des conditions matérielles de travail et des moyens généraux ;
- le bureau informatique et bureautique, chargé, pour la direction, de la préparation et de la gestion du budget informatique, ainsi que de l'animation et de la coordination du plan directeur informatique. Il assure la gestion du parc matériel, l'assistance aux utilisateurs, l'animation et le développement des compétences des utilisateurs, l'administration des serveurs et des réseaux ainsi que l'assistance à la maîtrise d'ouvrage pour les différentes entités de la direction, à l'exception du service économique et statistique ;
- la cellule de la formation, chargée de la politique de formation de la direction ;
- la cellule documentation, chargée de l'acquisition et du traitement des ressources documentaires.