La sous-direction de la recherche, de l'innovation, du développement et de la coopération internationale comprend :
- le bureau de la recherche et des interactions avec la formation ;
- le bureau du développement et des interactions avec la recherche ;
- le bureau de la mission de l'enseignement agricole pour l'animation et le développement des territoires ;
- le bureau des relations européennes et de la coopération internationale de l'enseignement agricole.