L'affectation, en présence de tous les étudiants, offre une possibilité de modifier la simulation effectuée par procédure informatisée. Elle se déroule de la façon suivante :
Les candidats sont convoqués chaque jour, par tranche en fonction du rang de classement.
Chaque candidat, appelé par rang de classement, choisit son affectation qui devient alors définitive.
Si à l'appel de son nom, un candidat est constaté absent et s'il a émis des voeux d'affectation, le premier voeu possible est retenu pour son affectation définitive. Toutefois, en cas de retard, il a la possibilité de choisir son affectation immédiatement après le dernier candidat appelé à choisir, dans sa tranche. Dans ce cas, il fait connaître expressément à l'administration sa décision de renoncer au bénéfice de l'affectation prononcée en fonction de ses voeux. Son choix se substitue à l'affectation prononcée précédemment.