La direction centrale du génie comprend également :
- la sous-direction opérations-emploi ;
- la sous-direction administration-finances ;
- la sous-direction organisation-ressources.
Les sous-directeurs sont placés sous l'autorité du directeur central du génie. Dans leurs domaines de responsabilité respectifs, ils proposent les évolutions relatives à l'organisation, aux systèmes d'information, aux modes d'action et au fonctionnement du service du génie et s'assurent des résultats correspondant aux objectifs assignés par le directeur central.