La direction des affaires financières et de l'administration générale comprend :
- la sous-direction des affaires financières ;
- la sous-direction des affaires juridiques ;
- la sous-direction des prestations logistiques et du cadre de vie de l'administration centrale ;
- la sous-direction des réseaux et des systèmes d'information d'administration centrale ;
- le département de la modernisation financière et de l'innovation technologique ;
- le secrétariat général.
Le directeur est assisté d'un adjoint.