La pêche s'exerce conformément à la réglementation en vigueur sur les affluents de l'Ognon.
Afin de préserver leur très haute valeur biologique, la pêche est interdite sur les affluents de la Moselle, sur la Savoureuse, le Rahin et leurs affluents.
L'alevinage est interdit sur l'ensemble des cours d'eau de la réserve.