Le conseil d'administration est composé de vingt membres :
1° Représentants de l'Etat :
- un membre du Conseil général des ponts et chaussées ;
- quatre directeurs d'administration centrale ou chefs de service à compétence nationale de la direction générale de l'aviation civile, ou leurs représentants ;
- le directeur de la recherche et des affaires scientifiques et techniques du ministère chargé des transports ou son représentant ;
2° Personnalités :
- quatre personnalités qualifiées désignées en raison de leur compétence, issues des branches professionnelles correspondant aux activités de l'école ;
- un représentant du conseil régional de Midi-Pyrénées ;
- un représentant des anciens élèves exerçant son activité professionnelle en dehors des services de l'Etat ;
- trois personnalités qualifiées désignées parmi les personnels en service au sein de la direction générale de l'aviation civile ;
3° Représentants du personnel et des élèves :
- deux représentants élus du personnel exerçant des fonctions d'enseignement ou de recherche au sein de l'école ;
- un membre élu du personnel n'exerçant pas des fonctions d'enseignement ou de recherche ;
- deux représentants élus des élèves, dont un représentant des élèves ingénieurs de l'école et un représentant des élèves suivant les formations professionnelles de la direction générale de l'aviation civile.
Les représentants du personnel et des élèves peuvent, en cas d'empêchement, être remplacés par un suppléant désigné dans les mêmes conditions que le titulaire.
Le directeur de l'école, l'autorité chargée du contrôle financier et l'agent comptable assistent aux séances du conseil avec voix consultative.