Ce comité de pilotage est coprésidé par un représentant du ministre de l'économie et des finances et un représentant du ministre chargé de la coopération et du développement. Il est également composé de trois membres, respectivement désignés par :
- le ministre des affaires étrangères ;
- le ministre chargé de la santé ;
- le ministre chargé du budget.
Le directeur général de l'Agence française de développement ou un de ses représentants participe à ce comité, sans voix délibérative.