La direction de la protection judiciaire de la jeunesse comprend :
- l'inspection des services de protection judiciaire de la jeunesse ;
- la sous-direction des missions de protection judiciaire et d'éducation ;
- la sous-direction du pilotage et de l'optimisation des moyens ;
- la sous-direction des ressources humaines et des relations sociales ;
- la mission d'appui méthodologique à la fonction de direction territoriale ;
- la cellule de la communication.
Certaines actions particulières à durée limitée peuvent être coordonnées par des directions de projet directement rattachées au directeur.