Le secrétariat général comprend les directions, services et missions suivants :
- la direction des affaires économiques et internationales ;
- la direction de la recherche et de l'animation scientifique et technique ;
- le service de l'information et de la communication ;
- le service du personnel et de l'administration ;
- le service du pilotage des services et de la modernisation ;
- la mission de la stratégie ;
- la mission des cadres dirigeants et des écoles.