Le comité directeur de l'océanographie militaire est assisté d'un bureau exécutif.
Le directeur des systèmes de forces et de la prospective désigne, parmi les membres du bureau exécutif relevant de son autorité, l'ingénieur, président de ce bureau, ainsi que son suppléant. Le président du bureau rend compte de son action au comité directeur.
Le bureau exécutif prépare les travaux du comité directeur et coordonne l'exécution des mesures arrêtées.
Sont membres du bureau exécutif :
- un ingénieur désigné par le chef du service de la recherche et des études amont ;
- un ingénieur désigné par le chef du service des stratégies techniques et des technologies communes ;
- un ingénieur désigné par le chef du service des programmes d'observation, de télécommunication et d'information ;
- un ingénieur désigné par le chef du service des programmes navals ;
- un ingénieur désigné par le directeur des centres d'expertise et d'essais ;
- un officier de la division « plans », un officier de la division « programmes », un officier de la division « opérations-logistique » et un officier chargé de coordonner l'environnement météo-océanographique au sein de l'état-major de la marine, désigné par le chef d'état-major de la marine ;
- un ingénieur désigné par le directeur du service hydrographique et océanographique de la marine, secrétaire.
Le bureau exécutif se réunit à l'initiative de son président, qui peut inviter à participer aux travaux, en tant que de besoin, des représentants d'autres services et directions du ministère de la défense, ainsi que des représentants d'organismes extérieurs au ministère de la défense.
Chaque membre a un suppléant désigné qui le remplace en cas d'absence. Il peut se faire accompagner, en tant que de besoin, de personnes de son service intéressées par l'ordre du jour.