La sous-direction du recrutement et de la gestion des carrières assure la gestion des enseignants-chercheurs de statut universitaire et de statut hospitalo-universitaire. Elle gère la procédure de qualification, organise les concours de l'agrégation et procède aux actes de gestion administrative pour ces personnels.
La sous-direction du recrutement et de la gestion des carrières est constituée :
- du bureau des lettres et des sciences humaines ;
- du bureau du droit, de l'économie et de la gestion ;
- du bureau des sciences ;
- du bureau des personnels de santé.