Le département des affaires générales
Il assure, pour le compte de la direction générale, la gestion des ressources humaines et la politique de formation, la gestion du budget et des marchés, contrats et conventions, ainsi que la logistique et l'informatique. Il est chargé du contrôle de gestion de la direction générale.
La mission des relations internationales
Elle coordonne les activités internationales de la direction générale. Elle assure la représentation de la direction générale dans les enceintes internationales traitant des sujets relatifs à la modernisation de l'Etat, notamment les groupes de travail de l'Union européenne et le Comité de la gouvernance publique de l'OCDE.
La mission de synthèse
Elle assure la programmation et la synthèse des travaux conduits par la direction générale. Elle élabore le rapport annuel rendant compte des activités et des résultats atteints.
En outre, le secrétariat général assure la sécurité des systèmes d'information pour le compte de la direction générale.