Le président du conseil dirige l'agence.
Il a autorité sur les personnels de l'agence.
Il nomme le secrétaire général chargé de l'organisation administrative de l'agence à qui il peut déléguer sa signature pour tous les actes relatifs au fonctionnement de l'agence et à l'exercice de ses missions.
Il est ordonnateur des dépenses.
Sans préjudice du contrôle exercé par la Cour des comptes, dans les conditions prévues par le code des juridictions financières, l'agence n'est pas soumise au contrôle financier prévu au décret du 27 janvier 2005 susvisé.
Le président peut déléguer sa signature aux directeurs de section pour les affaires relevant de leur compétence.